Este espaço museológico conta com 23 hectares, onde se conseguiu manter a traça original e os objetos utilizados tradicionalmente no fabrico do Queijo de Azeitão. Durante a visita aprender-se a história e a confeção artesanal deste queijo, terminando com uma degustação.

Edifício do século XVIII decorado com azulejos do mestre azulejador P. M. P. e com tetos pintados, onde está representado Santelmo (o orago da antiga Confraria do Corpo Santo). Possui uma pequena capela revestida a talha dourada e no primeiro andar uma sala adaptada para sala de exposições temporárias.

O Museu que ocupa, de origem, o edifício do Convento de Jesus de Setúbal, com cerca de 500 anos de cariz histórico e artístico, expõe variadas coleções destacando-se a arte sacra (pintura, escultura, ourivesaria, desde o século XV ao XIX) e os "Primitivos de Setúbal", ou seja, o Retábulo da igreja de Jesus, de cerca de 1520-30, constituído por catorze painéis de pintura a óleo sobre madeira atribuídos ao Pintor régio de D. Manuel I Jorge Afonso.

Espaço onde poderá ver coleções de arqueologia, especialmente da zona a sul do distrito. Possui uma secção de etnografia ligada às tradições piscatórias e agrícolas da região e miniaturas de barcos e de unidades industriais executadas pelo artista popular Borda d'Água.

Esculturas e instalações artísticas, da autoria de João Limpinho, integradas em espaços públicos dos bairros da Bela Vista.

Biblioteca com um espaço para apresentação de livros e com galeria para exposições temporárias.

Espaço instalado numa antiga fábrica de conservas de peixe, onde poderá ver coleções de alfaias agrícolas pertencentes a Michel Giacometti, maquinaria industrial relativa às conservas e litografia.

Galeria de exposições temporárias de arte e documentação sobre a vida e a obra de Bocage. Dispõe de peças de arte e livros do Museu de Setúbal/Convento de Jesus e documentos da Biblioteca Municipal de Setúbal que retratam a figura e obra de Bocage, nascido em Setúbal em 1765. Conta ainda com o Arquivo Fotográfico Américo Ribeiro e Centro de Documentação Bocagiano, ligado pela internet, a bibliotecas e centros de estudo.