Funciona na capela da Ordem Terceira, anexa ao Convento de São Francisco e apresenta uma coleção de esculturas flamengas do século XVI e outras estátuas religiosas dos séculos XVII e XVIII, talha dourada, azulejaria e pintura. Realça-se, ainda, o mobiliário sacro, a paramentaria do século XVIII e as pratas dos séculos XVI, XVII e XVIII.
Neste espaço poderá apreciar uma coleção notável de artefactos de ossos e dentes de baleia e cachalote esculpidos. "Scrimshaw" é o nome da técnica de esculpir dentes de cachalote, antigamente passatempo de marinheiros e baleeiros. Inclui ainda uma exposição de livros com dedicatórias e recordações dos velejadores que visitaram o Peter Café Sport.
O espaço, que se encontra no subsolo, foi inaugurado em agosto de 2008 e pretende recriar e dar a conhecer ao visitante, através da utilização de meios multimédia, a erupção de 1957 que ocorreu ao junto à costa do Faial. Faz parte do Centro de Interpretação o Farol dos Capelinhos, com uma vista privilegiada sobre os resultados paisagísticos do fenómeno vulcânico. Inclui ainda um auditório onde se pode visualizar um filme 3D sobre a formação da terra, uma sala com exposições temporárias, e as diversas salas da exposição interpretativa: "Os faróis", "A erupção", "O vulcão", "Vulcões no Mundo", "Açores" e …
