Este núcleo se encuentra dentro de la high School secundaria. Presenta los hallazgos de las excavaciones en un medieval capilla y necrópolis tardo-romana, a lo largo del Guadiana.
La antigua ciudadela, así como importantes secciones de la muralla que rodeaba la población, aún se conservan. Los trabajos arqueológicos realizados en la Ciudadela del castillo descubrieron un barrio morisco del siglos XII\/XIII y varias estructuras romanas del siglo IV. Las piezas de cerámica árabe encontradas están expuestas en la base del Museo de Mértola.
A Casa do Mineiro – Centro de Documentação, é o primeiro pólo permanente do Museu da Mina de São Domingos. A sua construção pretende ser um contributo para a reconstrução e dignificação da aldeia mineira, das suas gentes e da sua memória. Nessa perspectiva, associaram-se a este espaço dois equipamentos. O museográfico, com a (re) criação da Casa do Mineiro, e o espaço de recolha da memória, com a instalação dum Centro de Documentação.
Espacio insertado en el convento de San Francisco de Mértola. Muestra sistemas de riego utilizados desde la época musulmana y la importancia que tenían. También se puede aprovechar la visita al convento para el jardín botánico, la reserva ornitológica y la galería de arte.